El Colegio Jesuita de Belmonte fue la última de las fundaciones que autorizara personalmente San Ignacio de Loyola. Se realiza mediante acuerdo llevado a cabo entre San Francisco de Borja y don Diego López Pacheco, II Marqués de Villena, Duque de Escalona y Señor de Belmonte.

La primera casa-convento instalada inicialmente es la que hace esquina con la calle Condestable Lucas de Iranzo, la que baja desde la torre de La Colegiata a la calle de Fray Luis de León, según crónicas de los propios Jesuitas es la casa que está debajo de la torre. Y así, ya desde los primeros tiempos de la Fundación se comenzaron la obras de edificación de lo que sería este famoso e importante Colegio, en las dependencias que los conocemos actualmente; obras que quedarían definitivamente concluidas el 18 de febrero de 1640, fecha en que según las actas capitulares de La Colegiata, se hizo traslado solemne del Santísimo Sacramento a la Iglesia nueva que han edificado. Así es como la Compañía de Jesús funda el Belmonte el primer Colegio de España que tuviera internado.